Hal ini terjadi setelah pemberontakan Trunajaya dapat dipadamkan dengan bantuan VOC pada tahun 1678.
Pada tahun 1820, Pemalang diperintah oleh Bupati bernama Mas Tumenggung Suralaya, yang memiliki hubungan erat dengan tokoh Kanjeng Swargi atau Kanjeng Pontang, seorang Bupati yang terlibat dalam perang Diponegoro.
Terdapat catatan yang menunjukkan bahwa Bupati-bupati Tegal, Kendal, dan Batang membantu Belanda dalam perang Diponegoro, namun tidak ada catatan yang menyebutkan Bupati Pemalang terlibat.
Pada tahun 1832, Bupati Pemalang adalah Raden Tumenggung Sumo Negoro, di mana kemakmuran melimpah ruah akibat berhasilnya pertanian di daerah Pemalang, yang merupakan penghasil padi, kopi, tembakau, dan kacang.
Pusat Kabupaten Pemalang telah berpindah beberapa kali. Awalnya berada di Desa Oneng dan kemudian di Ketandan.
Saat ini, pusat Kabupaten Pemalang berada dekat Alun-alun Kota Pemalang dan merupakan hasil dari bangunan kolonial Belanda yang telah mengalami rehab dan renovasi.
Sebagai penghormatan atas sejarah terbentuknya Kabupaten Pemalang, pemerintah daerah telah menetapkan Hari Jadi Pemalang.
Meskipun terdapat perdebatan tentang tanggal pasti, tetapi berdasarkan diskusi para pakar, Hari Jadi Pemalang ditetapkan sebagai tanggal 24 Januari 1575, yang bertepatan dengan Hari Kamis Kliwon tanggal 1 Syawal 1496 Je 982 Hijriah.